Севастопольский яхт-клуб начал отсчет своей истории с 11 июня 1886 года.
Великий князь Алексей Александрович взял яхт-клуб под свое покровительство, и Севастопольский стал вторым, после Санкт-Петербургского, Императорским яхт-клубом. Вскоре на Приморском бульваре было воздвигнуто большое здание яхт-клуба. Стоянка яхт была у причалов нынешнего 44-го спортивного клуба флота.
Первым командором яхт-клуба был вице-адмирал М. Д. Новиков — начальник штаба Черноморского флота.
До 1920 года командорами яхт-клуба всегда были адмиралы. Почетными членами яхт-клуба были многие выдающиеся люди, среди них художник Айвазовский, путешественник Миклухо-Маклай, писатель-маринист Станюкович. Командиры кораблей и частей флота, жители Севастополя также были членами яхт-клуба.
В 1928 году парусный спорт был включен в программу I Всесоюзной спартакиады. В 1939 году на спартакиаде ВЦСПС в гонках швертботов класса «М» победил Павел Сергеевич Якшаров — старейший спортсмен яхт-клуба. Это была первая крупная победа севастопольцев. С 1948 года парусники принимали участие в чемпионатах РСФСР, регулярно занимая призовые места. С 1960 года в яхт-клубе начала работать водно-моторная секция.
В 1962 году на базе водно-моторной секции начала работать водно-лыжная секция.
Начиная с 1951 по 1991 год гребцы секции 24 раза становились чемпионами СССР. Уже в новейшей истории гребцы 28 раз становились чемпионами и победителями Кубков России. 335 мастеров спорта и 11 мастеров спорта международного класса России по гребле и гребно-парусному многоборью — это рекордное и до сих пор непревзойденное достижение в истории спортивных учреждений и в СССР, и в России!
С 1 декабря 2010 года входит в состав 175-го центра (морской и физической) подготовки как водно-спортивная станция. С 1 августа 2014 года водно-спортивная станция входит в состав СЦ (МиФП, г. Севастополь) ФАУ МО РФ ЦСКА.
11 июня 2016 года 57-й яхт-клуб Черноморского флота отметил свое 130-летие. Старейшее спортивное учреждение Вооруженных Сил Российской Федерации, основанное еще героями Синопского боя и Крымской кампании, продолжает жить активной спортивной жизнью.
